目的 采用生物信息学分析,筛选与三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer, TNBC)发生发展相关的关键基因和通路。 方法 选取GEO (Gene Expression Omnibus)数据库中TNBC基因芯片数据集GSE76124及正常乳腺组织数据集GSE112825,应用R软件筛选差异表达基因。使用DAVID数据库对上述差异表达基因进行GO (Gene Ontology)功能分析及KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome)通路分析。应用STRING在线数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并筛选TNBC的hub genes、枢纽模块和seed genes。 结果 分析芯片数据,筛选得到1091个差异表达基因,GO和KEGG分析结果显示,差异表达基因与芳香类物质生物合成、杂环生物合成等过程有关,并富集在cancer通路、PI3K/AKT通路上。通过构建PPI网络筛选得到了10个hub genes、2个枢纽模块和19个seed genes。 结论 本研究筛选得到10个hub genes和19个seed genes,这些基因在TNBC的发生发展中可能存在潜在的作用,为下一步研究提供生物信息学分析参考。

目的 研究片段冻存及整体冻存小鼠卵巢组织对玻璃化冷冻效果的影响。 方法 取小鼠卵巢组织,随机分为片段冻存组、整体冻存组和新鲜对照组。新鲜对照组卵巢取出后立即固定于4%多聚甲醛中,片段冻存组卵巢切割成1×1×1mm ³大小后冻存,整体冻存组卵巢不进行切割处理直接冻存。各组小鼠卵巢常规石蜡包埋,切片后HE染色。计数各组卵巢形态正常卵泡数,计算形态正常卵泡率,测量各组各类卵泡直径。 结果 整体冻存组、片段冻存组正常卵泡率明显低于新鲜对照组（P<0.01）;整体冻存组、片段冻存组正常卵泡率比较,差异无统计学意义（P>0.05）。整体冻存组、片段冻存组原始卵泡、初级卵泡、次级卵泡、窦状卵泡直径均明显高于新鲜对照组（P<0.05）;整体冻存组、片段冻存组各类卵泡直径比较,差异均无统计学意义（P>0.05）。 结论 整体冻存小鼠卵巢组织不影响玻璃化冷冻的效果。